Декомпилируешь обе модели;

Открываешь 1-ю модель в 3D редакторе, где тебе нужно заменить руки;

Импортируешь 2-ю модель, откуда тебе нужно перетянуть руки;

Удаляешь исходные модели рук и привязываешь к костям скелета новые руки;

Далее, уже все собираешь в mdl файл.

mdldecompiller, получишь много smd, bmp файлов и один qc, на каждую модель;

Подойдет простой 3д редактор для таких целей, например - MilkShape 3D;

Import в редакторе MilkShape 3D smd файлов;

Тут уже работа в самом редакторе;

StudioMDL